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MongoDB mmapv1存儲引擎解析

mongodb的mongod服務管理一個數據目錄,可包含多個DB,每個DB的數據單獨組織,本文主要介紹mmapv1存儲引擎的數據組織方式。

Database

每個Database(DB)由一個.ns文件及若幹個數據文件組成

$ll mydb.*
-rw-------  1 ydzhang  staff  67108864  7  4 14:05 mydb.0
-rw-------  1 ydzhang  staff  16777216  7  4 14:05 mydb.ns

數據文件從0開始編號,依次為mydb.0、mydb.1、mydb.2等,文件大小從64MB起,依次倍增,最大為2GB。

Namespace

每個DB包含多個namespace(對應mongodb的collection名),mydb.ns實際上是一個hash表(采用線性探測方式解決衝突),用於快速定位某個namespace的起始位置。

hash表裏的一個節點包含的元數據結構如下,每個節點大小為628Bytes,16M的NS文件最多可存儲26715個namespace。

struct Node {
    int hash;
    Namespace key;
    NamespaceDetails value;
};

  • key為namespace的名字,為固定長度128字節的字符數組。
  • hash為namespce的hash值,用於快速查找
  • value包含一個namespace所有的元數據

namespace元數據結構如下:

class NamespaceDetails {
    DiskLoc firstExtent; // 第一個extent位置
    DiskLoc lastExtent;  // 最後一個extent位置
    DiskLoc deletedListSmall[SmallBuckets]; 
    // 不同大小的刪除記錄列表
    ...
};

其中DiskLoc代表某個數據文件的具體偏移位置,數據文件使用mmap映射到內存空間進行管理,內存的管理(哪些數據何時換入/換出)完全交給OS管理。

 class DiskLoc {
    int _a;  // 數據文件編號,如mydb.0編號為0
    int ofs; // 文件內部偏移
 };

數據文件

每個數據文件被劃分成多個extent,每個extent隻包含一個namespace的數據,同一個namespace的所有extent之間以雙向鏈表形式組織。

namesapce的元數據裏包含指向第一個及最後一個extent的位置指針,通過這些信息,就可以遍曆一個namespace下的所有extent數據。

每個數據文件包含一個固定長度頭部DataFileHeader

 class DataFileHeader {
    DataFileVersion version;
    int fileLength;
    DiskLoc unused;
    int unusedLength;
    DiskLoc freeListStart;
    DiskLoc freeListEnd;
    char reserve[];
 };

Header中包含數據文件版本、文件大小、未使用空間位置及長度、空閑extent鏈表起始及結束位置。extent被回收時,就會放到數據文件對應的空閑extent鏈表裏。

unusedLength為數據文件未被使用過的空間長度,unused則指向未使用空間的起始位置。

Extent

每個extent包含多個Record(對應mongodb的document),同一個extent下的所有record以雙向鏈表形式組織。

struct Extent {
    unsigned magic;  // 用於檢查extent數據有效性
    DiskLoc myLoc;   // extent自身位置

    /* 前一個/後一個 extent位置指針 */
    DiskLoc xnext;
    DiskLoc xprev;

    int length;  // extent總長度 

    DiskLoc firstRecord;  // extent內第一個record位置指針
    DiskLoc lastRecord;   // extent內最後一個record位置指針
    char _extentData[4];  // extent數據
};

Record

每個Record對應mongodb裏的一個文檔,每個Record包含固定長度16bytes的描述信息。

class Record {
    int _lengthWithHeaders;  // Record長度
    int _extentOfs;          // Record所在的extent位置指針
    int _nextOfs;            // 前一個Record位置信息
    int _prevOfs;            // 後一個Record位置信息
    char _data[4];           // Record數據
};

Record被刪除後,會以DeleteRecord的形式存儲,其前兩個字段與Record是一致的。

class DeletedRecord {
   int _lengthWithHeaders;  // record長度
   int _extentOfs;          // record所在的extent位置指針
   DiskLoc _nextDeleted;    // 下一個已刪除記錄的位置
};

一個namespace下的所有的已刪除記錄(可以回收並複用的存儲空間)以單向鏈表的形式,為了最大化存儲空間利用率,不同size(32B、64B、128B...)的記錄被掛在不同的鏈表上,NamespaceDetail裏的deletedListSmall/deletedListLarge包含指向這些不同大小鏈表頭部的指針。

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寫入Record

  1. 檢查對應的namespace對應的刪除記錄鏈表裏是否有合適的DeletedRecord可以利用,如果有,則直接複用刪除空間寫入記錄。
  2. 檢查數據文件的freeList裏是否有合適大小的空閑extent可以利用,如果有則直接利用空閑的extent,將記錄寫入。
  3. 第1、2步都不成功,則寫創建新的extent寫入記錄;創建新extent時,如果當前的數據文件沒有足夠的空閑空間,則創建新的數據文件。

刪除Record

刪除的記錄會以DeleteRecord的形式插入到對應集合的刪除鏈表裏,刪除的空間在下一次寫入新的記錄時可能會被利用上;但也有可能一直用不上而浪費。比如某個128Bytes大小的記錄被刪除後,接下來寫入的記錄一直大於128B,則這個128B的DeletedRecord不能有效的被利用。

當刪除很多時,可能產生很多不能重複利用的"存儲碎片",從而導致存儲空間大量浪費;可通過對集合進行compact來整理存儲碎片。

更新Record

更新Record時,分2種情況

  1. 更新的Record比原來小,可以直接複用現有的空間(原地更新);多餘的空間如果足夠多,會將剩餘空間插入到DeletedRecord鏈表;
  2. 更新的Record比原來大,更新相當於刪除 + 新寫入,原來的空間會插入到DeletedRecord鏈表裏。

更新跟刪除類似,也有可能產生很多存儲碎片;如果業務場景裏更新很多,可通過合理設置Record Padding,盡量讓每次更新都直接複用現有存儲空間。

查詢Record

沒有索引的情況下,查詢某個Record需要遍曆整個集合,讀取出符合條件的Record;如果經常需要根據每個緯度查詢Record,則需要給集合建立索引以提供查詢效率。

最後更新:2017-04-01 13:37:07

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